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TUhjnbcbe - 2021/5/10 15:44:00

日本医院的金田笃志教授与新加坡国立大学医学部的PatrickTan教授等人组成的研究团队,针对爱泼斯坦-巴尔(EB)病*相关性胃癌,查清了病*感染引发胃癌的机制。本研究通过组合使用全面解析基因组修饰和基因组三维结构的技术,以及人为使胃部细胞感染病*的技术,发现了全新的致癌机制,并将其命名为“增强子侵袭”。这项成果有助于查清以胃癌为首的很多病*相关性恶性肿瘤的致病原因并确立治疗方法。

生物的基本设计图绘制在名为基因组的所有遗传信息中。细胞的性质由名为表观基因组的基因组修饰信息决定。基因组序列中没用的部分会被修饰为“失活标记”封闭起来,使其无法利用。

众所周知,癌症是基因组序列的突变和表观基因组的异常不断积累引起的,例如,抑制细胞过度增殖的基因是维持正常细胞所必须的,但基因组序列发生突变会导致其功能丧失,或者被误修饰为“失活标记”(DNA甲基化等),由此会导致这种基因的表达消失,从而引发癌症。

EB病*相关性胃癌(感染EB病*引发的恶性肿瘤之一,此外还可导致鼻咽癌和淋巴瘤等)是占所有胃癌8-10%的恶性肿瘤,但关于从感染病*到引起癌变的机制还有很多不明之处。此次,研究团队在EB病*相关性胃癌的特征基因组区域发现了部分强力“失活标记”消失的现象,并全面进行了比较解析。

研究团队根据下述①~③的成果,查清了EB病*感染胃部细胞引起胃癌的机制。

①在EB病*相关性胃癌中确定发生异常的基因组区域

通过对各种胃癌细胞与正常胃部细胞进行比较解析发现,无论是哪种EB病*相关性胃癌,EB病*基本都会接近相同的基因组区域。这个区域大多是胃部细胞中本来应该封闭起来的失活区域,EB病*DNA接近后,原本应该存在的“失活标记”消失,该区域被激活。

②通过实验确认,感染病*会引起表观基因组异常

通过实验使胃部培养细胞感染EB病*,再现了EB病*接近与①一致的区域并异常激活该区域的情形。

③查清表观基因组异常的致癌机制

另外发现,病*接近区域的增强子也被异常激活,导致周边的增殖相关基因的表达量升高,细胞异常增殖。也就是说,EB病*感染胃部细胞后,总是攻击基本相同的灭活区域,唤醒沉睡的增强子,从而引起癌变。

感染的病*会剥下“失活标记”,唤醒被封闭沉睡的增强子,研究团队将这种全新的表观基因组致癌机制命名为病*的“增强子侵袭”。

图1:EB病*感染胃部细胞后,引起“增强子侵袭”,从而引发癌症的过程。i.在被封闭的失活区域沉睡的增强子(淡蓝色);ii.感染的EB病*基因组(蓝色)接近部分失活区域;iii.接近的区域被打开,沉睡的增强子也被激活(红色),导致周边的增殖相关基因的表达量升高。

题目:Cross-specieschromatininteractionsdrivetranscriptionalrewiringinEpstein-Barrviruspositivegastricadenocarcinoma期刊:NatureGeneticsDOI:10./s-00--7

文:JST客观日本编辑部

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