新型冠状病毒感染是一种病毒感染，目前应对病毒感染，虽然研发了一些抗病毒药物，但这些药物并不具备杀死病毒的能力，只是抑制病毒的复制，减少体内病毒载量，为免疫系统消灭病毒提供更多的时间机会而已，因此，抗病毒药物提倡在感染的早期，病毒大量复制的阶段应用效果最好，早期病毒大量复制会损伤组织甚至激发过度的免疫反应，最终引发重症，因此，一旦进展到重症，病毒复制已经不是重点，组织损伤已经出现，抗病毒药物也无计可施。
各种抗菌药物，是针对细菌感染而设计的，目前临床常用的抗菌药物，包括阿莫西林等青霉素类，头孢呋辛、头孢克肟等头孢菌素类，阿奇霉素、克拉霉素等大环内酯类、左氧氟沙星、莫西沙星等喹诺酮类，都是通过作用于细菌的不同靶位，如细胞壁、细胞膜，以及细胞内的DNA等遗传物质，干扰细菌的繁殖或直接破坏细菌的结构，发挥直接的杀菌作用或抑制细菌的生长繁殖而发挥抑菌作用的，因此，对于新冠病毒入侵引起的呼吸道感染，抗菌药物是无效的。
但是，在某些情况下，新冠病毒入侵后会继发肺部细菌感染，这种情况下，则需要使用抗菌药物来控制细菌感染，但是，病毒感染后是否有继发性的细菌感染，普通患者是无法鉴别的，需要由有经验的医生，根据患者的症状、体征、以及肺部影像学和化验指标综合起来判断，是一项非常专业性的工作。
一旦确诊了继发性细菌感染，使用抗菌药物要合理，应杜绝以下错误：
一抗菌药物按需给药
有些患者感染后口服抗菌药物，咳嗽的症状减轻，就把抗菌药物当做止咳药来使用，夜间咳嗽频繁的就临睡前吃一片，这种做法是非常错误的，服用抗菌药物后咳嗽缓解，是因为药物清除了一部分致病菌所致，但是抗菌药物要起到彻底根除细菌的效果，必须要连续的，规范的使用至少3天，大部分肺部感染则需要10-14天的规范抗菌治疗
二服药频次不规范
抗菌药物的药代动力学各具特色，尤其是半衰期各不相同，如各种青霉素、头孢菌素半衰期短，属于时间依赖性抗菌药物，也就是说，抗菌效果取决于药物与细菌接触的时间，接触的时间越长杀菌效果越好，因此，各种青霉素、头孢菌素类抗菌药物通常需要一天之内多次给药，一天服用3-4次，并且最好是间隔固定的时间服药，如一天需要服3次，给药间隔最好做到每8小时一次，而有些抗菌药物则属于浓度依赖性，如左氧氟沙星，莫西沙星等喹诺酮类，抗菌活性取决于药物所能达到的最高血药浓度，这样的品种最好将一天的总剂量一次顿服。